Mission T adalah operasi intelijen yang bertugas untuk menyelamatkan dunia dari keruntuhan! Sang karakter utama adalah Negoro, yang dilatih sebagai ninja sejak muda dan dibesarkan sebagai agen intelijen terbaik. Negoro bekerjasama dengan agen inteligen dan membawa misi untuk takdir dunia. Tujuan misi ini untuk mengembalikan peninggalan dari pencipta jenius Nikola Tesla, “Shards of Tesla”. Dapatkah keduanya menyelesaikan misi mereka dengan melewati agen intelijen dari negara lain yang mengincar fragmen yang sama?